Tendo como uma de suas ações estratégicas, a articulação é uma ação essencial para a criação de políticas públicas, mecanismos de apoio e marcos regulatórios impactantes ao setor de incubação de empresas no Brasil. Para isso, a Associação atua diretamente em conselhos consultivos/deliberativos e como membro de importantes entidades de fomento e nos principais fóruns de discussão, sobre temas como ciência e tecnologia, empreendedorismo inovador e pesquisa e desenvolvimento, entre outros. Dentre as atividades de participação da Anprotec em entidades parceiras, destacam-se: 

- Conselho Deliberativo Nacional do SEBRAE 
- Conselho Deliberativo da ABDI 
- Secretaria Técnica do PNI / MCT
- Secretaria Técnica da RELAPI
- Tríplice Aliança para Inovação junto com ANPEI e ABIPTI
- Fórum Permanente de MPEs/MDIC
- Membro da Frente Plurissetorial em Defesa da Ciência, Tecnologia e Inovação - Congresso Nacional
- Participante do Grupo de Trabalho sobre Capital de Risco - liderado pelo Ministério da Fazenda
- Articuladora e Membro da Aliança em Prol do Empreendedorismo Inovador no Brasil
- Conselho de Administração do CGEE
- Conselho de Administração do Softex